عصر یخبندان در حال پایان یافتن است. سه قهرمان قسمت پیشین- سید، مانی و دیه گو- که متوجه خطر زیر آب رفتن منطقه زیست خود و در نتیجه نابودی حیوانات شده اند، تصمیم می گیرند تا قبل از آب شدن یخ ها خود را به منطقه ای امن برسانند. آنها در طول راه با الی- یک ماموت ماده- و دو همراه وی کرش و ادی برخورد می کنند و …